外界屡屡抨击台北市疫苗施打速度慢，台北市长柯文哲今表示，中央有80瓶疫苗挂帐于台北市，还有770存放于其他医疗院所，数量一共有850瓶，前者他从未看过，后者施打速度也非市府能决定，所以即使市府都有按照程序在打，但永远都会有差额补不进去。
昨晚中央流行疫情指挥中心深夜发文，指政府尚未许可基层诊所接种疫苗，批北市府竟无视相关规定，任意将多达1000多剂的疫苗拨给诊所，不合规定也不合情理。
柯文哲对此反击，疫情在过去一个月发生得很突然，沐鸣高点号注册中央可能忘记4月21日曾发下公文，内容指出若合约医院疫苗过多，评估无法在效期内用毕，可在地方卫生局协助下将疫苗配送至其他合约医院、非合约医疗院所或卫生所儘速使用。
柯也感嘆，疫情爆发前打疫苗要七请八请，大家都不想打，但随着确诊、死亡案例飙升，大家急着要打，事实上也因为这样，所以公文前后也一直在变化，但4月底的公文的确有说，如果疫苗太多，要看看怎么去打掉，但疫苗被发到诊所这件事还是会检讨。
此外，关于中央寄放于北市的疫苗量，柯指出，中央说有650瓶寄放于北市医院，更精确来说应是850瓶。除配给给北荣、忠孝、北医等医疗院所的770瓶，其实还有80瓶是中央挂帐于台北市，但从来没发给我们。
话锋一转，柯也说，外界每次都在抨击台北市疫苗打得慢，因为中央挂了80瓶挂在北市，但他并不晓得在哪，另外770瓶的施打速度，也并非北市府能决定，「我也不觉得有什么不对，或有这见不得人的地方。」如外馆会造册送去医学中心打，但这些人打的速度很慢，因为有需要才打。
柯重申，市府都有按照程序在打，沐鸣代理注册但永远会有差额补不进去，原因就是这850瓶、8500人的速度，是北市府无法处理的。他也再次提醒中央，必须尽快做好疫苗的预约登录系统，若疫苗发下来结果系统还没好，老百姓会大乱。
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